無性繁殖的缺陷

目前的果樹大部分都是嫁接苗、扦插苗、甚至組織培育，這些都是無性繁殖。
無性繁殖有很多優點，因此大家都廣用此法來繁殖下一代。無性繁殖的特色是保留母本的優點，這個特性不只是優點，也是嚴重的缺點。
為利於經濟經營，大部分人的都是單一作物大面積種植，這樣的情況造成病蟲害很嚴重，其中的原因還帶有無性繁殖的缺點。
無性繁殖的基因都一樣，都一樣的基因造成大家都具有某些能力不足、對某些病蟲害較無抵抗力，而造成同一種病害或蟲害大面積的為害，或植株無法存活於氣候的變化。
另外自然界的生殖繁殖會造成基因的變異，讓物種有機會演化出更適合環境的新品種基因。無性繁殖造成這種機會的缺少，長久下來會造成該物種愈來愈衰弱。